La storia è incentrata su Yuki, figlia adottiva del preside della Cross Academy, scuola dove convivono studenti e umani e studenti vampiri, divisi opportunamente nella Day Class e nella Night Class, nell'utopia del direttore di far finalmente convivere le due razze in pace. Capodormitorio della Night Class è Kaname Kuran, affascinante vampiro di cui Yuki è, a quanto pare, innamorata fin da quando la salvò da bambina da un vampiro impazzito. Yuki, insieme al suo migliore amico Zero, anche lui in passato aggredito da un vampiro impazzito, fa parte del comitato disciplinare della scuola, che in pratica si occupa di non far scoprire agli studenti umani il fatto che i loro bellissimi vicini siano in realtà... un gruppo di vampiri dal sangue nobile! La storia prosegue tranquilla per qualche capitolo finchè non si scopre che anche Zero in realtà è un vampiro! Egli infatti fu morso da bambino, e adesso rischia di impazzire...